蛋白組學(xué)分為自下而上(Bottom-up)和自上而下(Top-down)法。目前自下而上這種策略已經(jīng)被廣泛使用,因?yàn)殡谋鹊鞍踪|(zhì)更容易分離和鑒定[1]。Bottom-up蛋白質(zhì)組學(xué)的典型樣品制備過程通常涵蓋蛋白質(zhì)提取、還原/烷基化處理、酶切、脫鹽等步驟。
其中蛋白質(zhì)提取與酶解是最為關(guān)鍵的兩個步驟,酶切消化的效率和特異性對蛋白及肽鑒定影響顯著,也是數(shù)據(jù)庫搜索算法的關(guān)鍵。優(yōu)化其特異性需用“測序級”胰蛋白酶并延長消化時間,但這帶來“緩慢且昂貴”問題,尤其臨床靶向定量中——過夜消化延遲結(jié)果,不符合科研/臨床需求。傳統(tǒng)LC-MS蛋白定量因胰蛋白酶消化成本高、速度慢,存在昂貴和通量低的缺點(diǎn),如今亟需簡單、快速、可重復(fù)的肽回收替代方法[2]。
圖1 自下而上蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程[3]
MagicOmics MMB帶著Advanced版升級方案——酶切體系重磅升級,此次升級,以前所未有的「速度-精度雙閾值突破」重新界定前處理標(biāo)準(zhǔn)!
本次升級基于MagicOmics MMB無需除鹽和廣泛兼容性等顯著優(yōu)勢,實(shí)現(xiàn)了性能的進(jìn)一步提升。在2小時酶切過程中,肽段回收率高達(dá)73.5%,漏切率則降至11%——這不僅標(biāo)志著實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的顯著改善,更標(biāo)志著臨床蛋白質(zhì)組學(xué)通量革命邁入了一個嶄新的階段。
經(jīng)過工藝迭代升級與反復(fù)驗(yàn)證,全新升級的MagicOmics MMB試劑盒,定于2025年8月正式推出。
青蓮自主研發(fā)的MagicOmics MMB試劑盒采用納米級磁珠進(jìn)行高效蛋白提取,其升級后的酶切體系憑借卓越性能,有效降低了漏切率,更顯著提高了肽段的回收率。
我們對10μg HeLa蛋白的微量樣本分別進(jìn)行了2小時和16小時的酶切蛋白組測試,再次驗(yàn)證了新一代酶切體系所取得的顯著成效:
圖2:不同酶切體系下肽段回收率對比
圖3:不同酶切體系下漏切率對比
從上述數(shù)據(jù)能夠清晰看出,青蓮百奧MagicOmics MMB試劑盒在肽段收率及漏切率上的優(yōu)秀表現(xiàn)。
傳統(tǒng)方案回收率不足65%,而青蓮百奧升級方案實(shí)現(xiàn)了74%的高回收突破,讓檢測更靈敏可靠。
傳統(tǒng)方案漏切率超過15%,青蓮百奧升級方案則將漏切率控制在11%以下,大大降低了假陽性的干擾。
傳統(tǒng)方案過夜酶切周期長,嚴(yán)重影響效率,青蓮百奧升級方案僅需2小時就能完成97%的酶解反應(yīng)。
MagicOmics MMB具備2小時極速酶切的能力,結(jié)合MagicOmics-AP-96-pro蛋白質(zhì)組學(xué)樣本前處理智能機(jī)器人,單批次4小時內(nèi)就能完成96例樣本處理,不同批次同一樣本相關(guān)性>0.96,大幅提升了宏蛋白組學(xué)和大隊(duì)列研究的效率。
MagicOmics MMB能高效助力微量/超微量樣本中的蛋白捕獲,精準(zhǔn)酶切降低漏切率,減少信息丟失以提升鑒定深度。自酶切峰媲美進(jìn)口酶,成本卻低 70%,兼顧質(zhì)量與經(jīng)濟(jì)性。
推薦采用MagicOmics MMB搭配PEB磷酸化肽段富集磁珠試劑盒的方案。該方案能實(shí)現(xiàn)磷酸化位點(diǎn)高達(dá)26000+,富集效率>90%,多位點(diǎn)磷酸化肽比例更是實(shí)現(xiàn)3倍提升,為翻譯后修飾-磷酸化相關(guān)研究提供了有力支持。
青蓮百奧針對科研樣本處理效率低和標(biāo)準(zhǔn)化難題,獨(dú)家推出了專利產(chǎn)品——MagicOmics磁珠試劑盒系列。該系列搭配自主研發(fā)的自動化蛋白組學(xué)前處理機(jī)器人及配套耗材,極大地提升了樣本處理的通量與實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性,為行業(yè)帶來了顛覆性的解決方案。針對高通量樣本檢測、標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程搭建以及科研成果快速轉(zhuǎn)化的需求,青蓮百奧獨(dú)家提供從試劑盒到自動化設(shè)備再到耗材的全方位科學(xué)工具全鏈條解決方案。
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