數(shù)據(jù)非依賴性采集（DIA）指在樣品進(jìn)入二級(jí)質(zhì)譜時(shí)按照設(shè)定的質(zhì)荷比（m/z）范圍對(duì)范圍內(nèi)所有母離子進(jìn)行碎片化。DIA方法不依賴信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)行母離子挑選，得到的數(shù)據(jù)量龐大且復(fù)雜，因此需要搜索預(yù)先對(duì)少量樣本通過(guò)數(shù)據(jù)依賴性采集（DDA）方法檢測(cè)構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行準(zhǔn)確匹配，從而提高鑒定準(zhǔn)確性。Direct DIA，即DDA-free DIA（dDIA）能夠利用機(jī)器深度學(xué)習(xí)直接通過(guò)搜索DIA原始譜圖生成數(shù)據(jù)庫(kù)，不用再進(jìn)行DDA建庫(kù)。dDIA能夠通過(guò)深度學(xué)習(xí)打分尋找譜峰碎裂規(guī)律，預(yù)測(cè)保留時(shí)間，去除假陽(yáng)性結(jié)果，在保留DIA優(yōu)勢(shì)的同時(shí)提高了效率。
極高通量
擅長(zhǎng)大隊(duì)列樣本定量分析
廣泛適用
適用于各種樣本，可分批送樣
準(zhǔn)確性高
不依賴信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)行母離子挑選，為后續(xù)的生物信息學(xué)分析提供豐富的數(shù)據(jù)
重復(fù)性好
使用內(nèi)標(biāo)校正肽段（iRT KIT）對(duì)不同樣品的保留時(shí)間進(jìn)行校正，適合珍貴樣本
注意事項(xiàng)
DIA定量蛋白質(zhì)組需要DDA建庫(kù)，16個(gè)樣本以下需額外支付建庫(kù)費(fèi)用，dDIA定量蛋白質(zhì)組無(wú)需建庫(kù)
臨床大隊(duì)列樣本的疾病分型、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)；生理、病理及感染免疫的機(jī)制研究；藥物的研發(fā)與藥效評(píng)估
動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育、遺傳育種及生態(tài)保護(hù)研究；生物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)及脅迫抗逆的機(jī)制研究；營(yíng)養(yǎng)與飼料成分的分析與優(yōu)化
食品營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與品質(zhì)的分析鑒定；產(chǎn)品成分的分析與優(yōu)化；食品安全的提升
項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)涵蓋多物種、多組織器官類型及多疾病類型，包括：
100+種人類器官、組織、細(xì)胞及疾病類型；
60+種小鼠器官、組織、細(xì)胞及疾病類型；
60+種醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧領(lǐng)域模式動(dòng)物及非常見動(dòng)物樣本；
60+種藥物、農(nóng)牧領(lǐng)域模式植物及非常見植物樣本；
60+種細(xì)菌、真菌等微生物樣本。
與100+所醫(yī)院、研究所等單位建立深度合作；
合作文章累積影響因子300+，發(fā)表于多部醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、植物等領(lǐng)域期刊。
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多種質(zhì)譜平臺(tái)選擇；
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。
發(fā)表期刊：Molecular Plant
影響因子：17.1
發(fā)表單位：中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所
發(fā)表時(shí)間：2019.12.05
| 樣本類型 | 送樣量 | |
| 動(dòng)物組織 | 常規(guī)組織（腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉等柔軟組織） | 10 mg |
| 堅(jiān)硬組織（軟骨、毛發(fā)） | 100 mg | |
| 植物組織 | 柔軟組織（木本植物的葉、花等，草本植物，藻類，蕨類植物） | 200 mg |
| 堅(jiān)硬組織（根、樹皮、樹枝，果實(shí)種子等） | 2 g | |
| 微生物 | 常見細(xì)菌、真菌菌體（菌體沉淀）、精細(xì)胞 | 30 μL |
| 細(xì)胞 | 懸浮/貼壁培養(yǎng)細(xì)胞（細(xì)胞計(jì)數(shù)/沉淀） | 2×106或20 μL |
| 液體類 | 血漿/血清（不去除高豐度） | 5 μL |
| 血漿/血清（去除高豐度-伯樂） | 100 μL | |
| 血漿/血清（去除高豐度-TOP2/TOP14） | 50 μL | |
| 血漿/血清（去除高豐度-DMB蛋白冠） | 50 μL | |
| 腦脊液（不去除高豐度） | 100 μL | |
| 腦脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 300 μL | |
| 卵泡液（不去高豐度） | 100 μL | |
| 卵泡液（去除高豐度-伯樂）、尿液，精液 | 1 mL | |
| 淋巴液、關(guān)節(jié)液、穿刺液、腹水 | 3 mL | |
| 唾液/淚液/乳汁 | 500 μL | |
| 培養(yǎng)基上清（不能使用含血清的培養(yǎng)基） | 5 mL | |
| FFPE | 每片厚度10 μm，面積1.5×2 cm | 2-5片 |
| 其他 | 蛋白溶液（最佳Buffer是8M Urea） | 10 μg |
傳統(tǒng)的DDA技術(shù)依賴于一級(jí)質(zhì)譜中母離子的峰強(qiáng)度選擇信號(hào)強(qiáng)度排名在前幾位的母離子進(jìn)行二級(jí)質(zhì)譜檢測(cè)，DIA技術(shù)將質(zhì)譜整個(gè)全掃描范圍分為若干個(gè)窗口，對(duì)每個(gè)窗口中的所有離子進(jìn)行選擇、碎裂、檢測(cè)，從而無(wú)遺漏、無(wú)差異地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息。
DIA的全掃描方式獲得的數(shù)據(jù)過(guò)于復(fù)雜，其每張二級(jí)譜圖中混合了來(lái)自于多個(gè)一級(jí)信號(hào)的信息，通常難以直接進(jìn)行理論庫(kù)匹配，一般需要先進(jìn)行DDA建庫(kù)輔助對(duì)DIA數(shù)據(jù)進(jìn)行高效、準(zhǔn)確地解析。
不過(guò)隨著機(jī)器深度學(xué)習(xí)技術(shù)的發(fā)展，目前spectronaut搜庫(kù)軟件支持DIA數(shù)據(jù)直接搜庫(kù)，檢出數(shù)據(jù)已達(dá)到與傳統(tǒng)的建庫(kù)方法相近的水平。
DIA是全息掃描模式，能全面記錄樣本信息，定量準(zhǔn)確性大大提高，重復(fù)性好，缺失值少，樣本采集時(shí)加入了保留時(shí)間校正同位素肽段，適合大隊(duì)列樣本，上機(jī)時(shí)間間隔可以較大，可分批送樣，數(shù)據(jù)可回溯。
增加離子淌度（ion mobility）分離，帶來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測(cè)周期、定量準(zhǔn)確性等性能上的革命性提升
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平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（PRM）能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)或肽段進(jìn)行選擇性檢測(cè)，不受抗體與種屬限制，是質(zhì)譜界的Western blot
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